А чего в своём файле /etc/init.d/mynat не указал блокировать всё по умолчанию?
iptables -P INPUT DROP
iptables -P FORWARD DROP
iptables -P OUTPUT DROP

?

Да и вообще несколько ошибок:
#!/bin/sh
#echo «1» > /proc/sys/net/ipv4/ip_forward
#разрешаем принимать ответы на запросы
iptables -A INPUT -m state --state ESTABLISHED -j ACCEPT
#Полностью разрешаем весь трафик на loopback
iptables -A INPUT -i lo -j ACCEPT
#Разрешаем трафик со стороны локальной сети
iptables -A INPUT -s 192.168.1.0/255.255.255.0 -i eth0:1 -j ACCEPT
# разрешу пока и свой ws30 - ну на время настройки
iptables -A INPUT -s 192.168.0.30 -i eth0 -j ACCEPT
#Все запросы на 80-й порт перенаправляем на squid
iptables -t nat -A PREROUTING -s 192.168.1.0/255.255.255.0 -p tcp --destination-p$
#Делаем маскарадинг из локальной сети в инет
iptables -t nat -A POSTROUTING -s 192.168.1.0/255.255.255.0 -j MASQUERADE
#Закрываем порты для торрента
iptables -I INPUT -p tcp --destination-port 6881:6999 -j DROP

Ну и раз уже вклинился:
"...С версии 12.04 за конфигурацию DNS отвечает программа resolvconf (вместо файла /etc/resolv.conf). Она позволяет осуществить настройку DNS на основе данных от разных программ и файлов конфигурации.
Одним из следствий этого полезного нововведения является то, что теперь файл /etc/resolv.conf генерируется автоматически. И не индивидуально каждой программой, которая его правит (например Network Manager или DHCP клиент), а через общий программный интерфейс. Это значит, что внесенные в /etc/resolv.conf изменения будут потеряны.
Вместо /etc/resolv.conf информацию о DNS для статических интерфейсов надо вносить в /etc/network/interfaces1) в параметры dns-nameservers, dns-search и dns-domain (которые соответствуют параметрам nameserver, search и domain в /etc/resolv.conf)

Обратите внимание - в /etc/resolv.conf, как правило записываются несколько nameserver, а в /etc/network/interfaces все адреса DNS серверов записываются в одну строчку после ключа dns-nameservers, разделенные пробелами...."
http://help.ubuntu.ru/wiki/настройка_сети_вручную